Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1249260	1249268	9	8 [0]	[0] 38	treA/dhaH	periplasmic trehalase/fused predicted dihydroxyacetone‑specific PTS enzyme HPr component and EI component

TGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCAGCGTTAGCGT  >  W3110S.gb/1249269‑1249320 |                                                    tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTa                   >  1:2113594/1‑35 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2620263/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1067982/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2208243/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:238910/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2420324/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2516432/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2556829/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2564328/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2612631/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2117540/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2698137/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:273676/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2757357/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2815071/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:570375/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:648517/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:713245/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:814468/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1605840/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1130158/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1147633/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1254394/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1327479/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1498977/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1561081/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1562055/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1564579/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2056612/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1609152/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1622601/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1677/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1890670/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:1974424/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:202823/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2047526/1‑52 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcg   >  1:2186615/1‑51 (MQ=255) tGGCTTAACCCTGAAGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCagcgttagcgt  >  1:2844556/1‑52 (MQ=255) |                                                    TGGCTTAACCCTGACGGTTGAAACGTTGCGTTTTAACGTCCAGCGTTAGCGT  >  W3110S.gb/1249269‑1249320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑