Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1342561	1342748	188	7 [0]	[0] 10	yciM	conserved hypothetical protein

GCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGC  >  W3110S.gb/1342749‑1342810 |                                                              gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:1333773/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:1696136/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:1786135/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:2152160/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:2392692/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:2866351/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:425565/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:429022/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:565084/62‑1 (MQ=255) gCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGc  <  1:756533/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCAATTGATGTTGCCGAACGCCTGGTGAAGCTGGGTAAAGATAAACAGCGCGTCGAAATTGC  >  W3110S.gb/1342749‑1342810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑