Missing coverage evidence...
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GCGCATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTGCGC  >  W3110S.gb/1350228‑1350289 |                                                              gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:1089939/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:1263092/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:136541/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:1565643/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:1609459/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:2210976/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:2458896/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:249151/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:2708016/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:2831396/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:427753/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:543463/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:625905/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:82025/62‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTgcgc  <  1:842733/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCGCATTTCGGCAACCGCCCAGTCGCCTTCTTTAAACTCGTGGTTCAGGCCACGGGCTGCGC  >  W3110S.gb/1350228‑1350289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑