Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1353340	1353436	97	6 [0]	[0] 18	ycjD	conserved hypothetical protein

CTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCTT  >  W3110S.gb/1353437‑1353498 |                                                              cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGGTTTAATCtt  <  1:1091451/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:844280/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1025913/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:525319/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:2847010/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:2493787/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:2026922/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1750821/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1634115/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1617130/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1614399/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1498537/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1453388/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1368177/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1134053/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1130713/62‑1 (MQ=255) cTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:1121157/62‑1 (MQ=255) cTTAAACCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCtt  <  1:648440/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTTAAATCACGCGCATTTGATTTAATTTTATCTATCACCTCATTCTGACAAGATTTAATCTT  >  W3110S.gb/1353437‑1353498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑