Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1385895	1385926	32	11 [0]	[0] 24	ycjX	conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain

ACAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGCC  >  W3110S.gb/1385927‑1385988 |                                                              aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2589055/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:986107/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:831033/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:675904/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:522743/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:510171/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:369638/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:355745/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2857665/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2790379/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:278882/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2666330/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1012276/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2134410/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:2104198/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1998269/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1670429/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1602453/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:15646/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1473213/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1392311/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1282977/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1274988/62‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGcc  <  1:1089114/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACAGCGTTTATCACCGCGATGGTTAATCAGTTGCTTAATATTCACGCCGGAGCACGTTTGCC  >  W3110S.gb/1385927‑1385988

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑