Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1386973	1387041	69	4 [0]	[0] 6	ycjX	conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain

CGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGT  >  W3110S.gb/1387042‑1387103 |                                                              cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGc    >  1:1600245/1‑60 (MQ=255) cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGt  >  1:1492159/1‑62 (MQ=255) cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGt  >  1:1921819/1‑62 (MQ=255) cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGt  >  1:1978453/1‑62 (MQ=255) cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGt  >  1:2245211/1‑62 (MQ=255) cGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGt  >  1:56500/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGATGGCGCACCGCTCACTGTTTATCCTGGCGAAGTTCCCGCACGTTTGCCTGGTCAGGCGT  >  W3110S.gb/1387042‑1387103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑