Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1407982	1407984	3	24 [0]	[0] 21	ydaL	conserved hypothetical protein

GCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTG  >  W3110S.gb/1407985‑1408046 |                                                              gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACACGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTg     >  1:117321/1‑59 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1626456/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:939919/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:876227/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:742998/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:627409/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:2885787/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:2710436/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:2584443/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:2055871/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:192527/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1659894/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1029854/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:158855/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1432220/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1430835/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1336511/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1297434/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1108423/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1044061/1‑62 (MQ=255) gCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTg  >  1:1043166/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCCGCAAAATGGTGTTCAGTTTTATTCAACAAGCCCTGGCGGATGGTTTGCGTAACGTGCTG  >  W3110S.gb/1407985‑1408046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑