Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1429803	1429947–1429814	12–145	21 [0]	[0] 11	lomR insH	ECK1366:JW5884+JW5904:b4570; Rac prophage region; hypothetical protein IS5 transposase and trans‑activator

GCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGG  >  W3110S.gb/1429948‑1430007 |                                                            gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAatgatgc  <  1:1787535/60‑2 (MQ=25) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:132297/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:1456301/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:167553/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:1803853/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:1933921/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:2334543/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:2716540/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:2866944/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:2892659/60‑1 (MQ=35) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg  <  1:647261/60‑1 (MQ=35) |                                                            GCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGG  >  W3110S.gb/1429948‑1430007

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑