Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1497565	1497624	60	3 [0]	[1] 49	ydcJ	conserved hypothetical protein

ATCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTA  >  W3110S.gb/1497624‑1497686  |                                                              aTCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATG‑CATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:593117/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:44395/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2442933/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1021392/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2712447/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2729517/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:275516/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2849363/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2876218/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:313123/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:328659/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:329616/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:409663/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2450407/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:50515/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:549435/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:578602/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:607721/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:63166/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:80840/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:88453/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:909471/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:959418/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1735576/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1053425/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1142569/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1344045/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1428391/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1623614/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:165732/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1669677/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1718900/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1725373/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2397767/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1802266/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1832713/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1852904/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1869296/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2015229/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2057016/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2179009/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:222147/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2226748/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2266188/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACATGACGCCACGTa  <  1:35200/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGTGATCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:476498/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGCTGATGAGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:1178784/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTGATGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:62303/62‑1 (MQ=255)  tCGGTTGATTCCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTa  <  1:2648209/62‑1 (MQ=255)  |                                                              ATCGGTTGATTGCTGATGTGGTCTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTA  >  W3110S.gb/1497624‑1497686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑