Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1529953	1529957	5	11 [0]	[0] 14	rhsE	rhsE element core protein RshE

CTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTA  >  W3110S.gb/1529958‑1530019 |                                                              cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1236028/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:147457/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1602298/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1713897/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1859586/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1900767/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:1962998/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:2060611/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:2208204/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:2245164/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:2294834/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:233718/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTa  <  1:2851148/62‑1 (MQ=35) cTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGAGTa  <  1:2830285/62‑1 (MQ=14) |                                                              CTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTGTA  >  W3110S.gb/1529958‑1530019

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑