Missing coverage evidence...
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TGACGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCA  >  W3110S.gb/1551298‑1551356 |                                                           tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2926035/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2084084/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1029622/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2104906/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2197996/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2415178/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2453964/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2634870/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2749024/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2087349/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:362049/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:456842/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:531223/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:620899/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:698593/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:791953/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:820894/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:944024/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1613770/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1125535/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1236419/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1240658/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1324062/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1404340/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1482920/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1516638/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2054691/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:181031/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1815834/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1860339/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1904472/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1928134/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:1955992/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGa              >  1:2042008/1‑47 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCa  >  1:2636870/1‑59 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCa  >  1:444612/1‑59 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCa  >  1:48633/1‑59 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCa  >  1:2453284/1‑59 (MQ=255) tgaCGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACAGGTAGCTgg               >  1:1346716/1‑46 (MQ=255) |                                                           TGACGGTACAACCGCATCTTCTTGCTGGATCTACACCGGTAGCTGGACAGAGCAGGGCA  >  W3110S.gb/1551298‑1551356

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑