Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1702633	1702652	20	9 [0]	[0] 43	malX	fused maltose and glucose‑specific PTS enzyme IIBC components

CAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGGTG  >  W3110S.gb/1702653‑1702714 |                                                              cAGGGATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1664660/1‑62 (MQ=255) cAGGCATATGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:304722/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCaaa                             >  1:663409/1‑35 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGt                          >  1:649476/1‑38 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATc                  >  1:2830573/1‑46 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGc          >  1:2258/1‑54 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATggag  >  1:2310685/1‑60 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:482322/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:326773/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:318565/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:616935/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:697847/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:715251/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2828532/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2825139/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2735744/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2692227/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2661634/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2549725/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:250119/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2477918/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1108826/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:958769/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1639273/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1184785/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1295949/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:133178/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1355831/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1361260/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1388347/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1445491/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1597875/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:228292/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1818498/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1885822/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:1936229/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2038417/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2066695/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2069233/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2183828/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgtg  >  1:2216532/1‑62 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGgt   >  1:1401901/1‑61 (MQ=255) cAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGACATGGCACAAGgtg  >  1:2244274/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAGGCATAAGGATAAGATATGTTCGATTTTTCAAAGGTCGTGGATCGTCATGGCACATGGTG  >  W3110S.gb/1702653‑1702714

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑