Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,303,602	A→T	Y236F (TAC→TTC)	oppA →	oligopeptide transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,303,602	0	A	T	100.0%	47.9 / NA	16	Y236F (TAC→TTC)	oppA	oligopeptide transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/16);  total (0/16)

ACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGA  >  W3110S.gb/1303598‑1303659     |                                                          aCCTTCTGGTACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1222314/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1158848/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1260419/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:148169/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1567127/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1714176/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2068049/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2069046/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2269442/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2334083/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:771034/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:788317/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:899921/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:989224/62‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGAACAAAGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:384775/62‑1 (MQ=255)  ccTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1801977/61‑1 (MQ=255)     |                                                          ACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGA  >  W3110S.gb/1303598‑1303659

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑