Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,303,633 G→T Q246Y (CAG→TAT oppA → oligopeptide transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,303,6330GT100.0% 195.3 / NA 59Q246Y (CAG→TAToppAoligopeptide transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (42/17);  total (42/17)

ACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGA  >  W3110S.gb/1303598‑1303659
                                   |                          
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aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2068049/62‑1 (MQ=255)
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aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2334083/62‑1 (MQ=255)
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aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:788317/62‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:2069046/62‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:771034/62‑1 (MQ=255)
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aCCTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:148169/62‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGAACAAAGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:384775/62‑1 (MQ=255)
 ccTTCTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:1801977/61‑1 (MQ=255)
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                         ttattaACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa  <  1:125103/37‑1 (MQ=37)
                                   |                          
ACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGA  >  W3110S.gb/1303598‑1303659

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: