| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 1,566,298 | G→A | L384L (CTG→TTG) | dos ← | cAMP phosphodiesterase, heme‑regulated |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 1,566,298 | 0 | G | A | 83.1% | 184.6 / 28.0 | 83 | L384L (CTG→TTG) | dos | cAMP phosphodiesterase, heme‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (14/0); new base A (0/69); total (14/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
ACGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTG > W3110S.gb/1566243‑1566355 | aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2394894/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2749859/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2737476/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2679268/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:267044/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2549910/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2531762/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2500324/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2468186/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:279435/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2354002/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:234605/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2169332/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2118354/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1018218/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2035960/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1911079/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1855009/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:722052/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:973851/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:92790/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:88904/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:858608/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:839105/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:753507/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:746383/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:728161/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2054658/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:685097/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:642236/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:52550/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:51613/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:45450/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:414942/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2824520/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:2798407/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1208783/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1587256/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1585329/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1850352/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1514280/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1512883/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1454699/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:133339/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1248643/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1567032/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:115058/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1143757/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1140652/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1109419/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1108104/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1103135/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1050359/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1034099/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1751410/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1736185/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:160168/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1625729/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1631341/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1646085/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1677728/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1673169/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1650990/62‑1 (MQ=255)aCGGCTTTGTAGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1810219/62‑1 (MQ=255) cGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:519564/61‑1 (MQ=255) cGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1194026/61‑1 (MQ=255) cGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1600432/61‑1 (MQ=255) cGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1522553/61‑1 (MQ=255) cGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAAACCGGt < 1:1703270/40‑1 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCt > 1:2556552/1‑61 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:1298717/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:2463160/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:524498/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:401317/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:334804/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:1149852/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:2719070/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:2098934/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:776904/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:2692049/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:1759432/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:1972580/1‑62 (MQ=255) ggCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTg > 1:1965326/1‑62 (MQ=255) | ACGGCTTTGTCGACCAGGTCATCGAGGTAATTGTGCAGGTTATTGCGATTTGGCAGACCGGTCATCGGATCAAATTGGATGAGTTGTTCAATATGCTGACGGCTTTTTTCCTG > W3110S.gb/1566243‑1566355 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |