Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,713,009	A→G	T156T (ACA→ACG)	rsxE →	predicted inner membrane NADH‑quinone reductase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,713,009	0	A	G	100.0%	135.9 / NA	40	T156T (ACA→ACG)	rsxE	predicted inner membrane NADH‑quinone reductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/40);  total (0/40)

CCATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACATTGTTTGACGGTGC  >  W3110S.gb/1712963‑1713023                                               |               ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:372991/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2323809/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2346149/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2417856/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2509896/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2621962/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2691891/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2863579/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2881868/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:35221/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2307371/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:37337/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:595939/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:70773/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:776117/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:905814/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:948416/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:9512/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:97288/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:983045/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1712067/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1190696/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1348898/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1355800/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1359333/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1434794/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1500208/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1577494/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1693632/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:170379/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1739432/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1792334/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:1902529/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2126387/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2143602/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2262862/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2268940/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2273108/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGTGc  <  1:2298931/61‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACGTTGTTTGACGGGGc  <  1:1100785/61‑1 (MQ=255)                                               |               CCATGTTCGTGCTGGGTTCACTACGCGAAATTATCGGCAATGGCACATTGTTTGACGGTGC  >  W3110S.gb/1712963‑1713023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑