Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,753,382	G→A	D19D (GAC→GAT)	ydhW ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,753,382	0	G	A	100.0%	241.6 / NA	74	D19D (GAC→GAT)	ydhW	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (74/0);  total (74/0)

TCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAAC  >  W3110S.gb/1753338‑1753387                                             |      tCAACTGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1130614/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCGACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1455872/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCTCTTCGCCTCATCaag  >  1:2658458/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATc     >  1:630869/1‑47 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2710048/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:452190/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:322997/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:296888/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2906108/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2831039/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2801580/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2736554/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:548925/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2663991/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:26411/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2584813/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2563588/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2549792/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2356815/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1011165/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:801206/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:986940/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:944552/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:941136/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:939897/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:902344/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:865553/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:865284/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:804987/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:502481/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:793706/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:765053/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:725946/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:676687/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:61197/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2354715/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:545631/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:122771/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1669751/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1605563/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1556853/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1508611/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1406498/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1405885/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1287603/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1264677/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1684446/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1220331/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1207846/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:118906/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1152565/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1105228/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1101459/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1089942/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1081213/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1899417/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2316189/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2289609/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2285010/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2227810/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2180939/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2061542/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1926939/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1901148/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:2329020/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1800728/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1797279/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1762012/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1732753/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaat  >  1:1721933/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaa   >  1:1858597/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaa   >  1:588074/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaa   >  1:354807/1‑49 (MQ=255) tCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCATCaa   >  1:2528692/1‑49 (MQ=255)                                             |      TCAACGGGGTGACGCATCCCCTGCAACCATTGCCGCTTCGCCTCGTCAAC  >  W3110S.gb/1753338‑1753387

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑