Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,757,552	T→G	I47M (ATT→ATG)	pykF →	pyruvate kinase I

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,757,552	0	T	G	100.0%	181.4 / NA	53	I47M (ATT→ATG)	pykF	pyruvate kinase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (5/48);  total (5/48)

TATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATTCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCAAA  >  W3110S.gb/1757501‑1757579                                                    |                            tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:287241/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2130083/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2212687/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:225210/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2498112/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2514842/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2539927/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2549509/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2550561/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2581834/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2643200/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2734479/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2216678/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:518361/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:55284/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:633935/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:649179/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:687608/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:707486/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:883711/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:899908/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:930853/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:955934/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:986601/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1577544/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1220213/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1317720/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1365476/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1393391/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1399396/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1451682/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1511481/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1538906/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1562693/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1569327/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1574266/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2112723/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1689398/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1726626/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1750953/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1765866/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1768394/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1777437/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1873765/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:1928005/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2053359/62‑1 (MQ=255) tATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:2056591/62‑1 (MQ=255)  aTGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTgc                   <  1:9617/61‑1 (MQ=255)                               ttcAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCaaa  >  1:1129688/3‑49 (MQ=255)                               tGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCaaa  >  1:2650819/1‑49 (MQ=255)                               tGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCaaa  >  1:72005/1‑49 (MQ=255)                               tGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCaaa  >  1:2299932/1‑49 (MQ=255)                               tGCAGAACACGGTCAGCGCATGCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCaaa  >  1:906926/1‑49 (MQ=255)                                                    |                            TATGCGTCTGAACTTCTCTCATGGTGACTATGCAGAACACGGTCAGCGCATTCAGAATCTGCGCAACGTGATGAGCAAA  >  W3110S.gb/1757501‑1757579

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑