Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,768,444	G→A	S652S (AGC→AGT)	ydiJ ←	predicted FAD‑linked oxidoreductase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,768,444	0	G	A	100.0%	180.8 / NA	57	S652S (AGC→AGT)	ydiJ	predicted FAD‑linked oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (57/0);  total (57/0)

TATTCGCATGCCAGCTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCA  >  W3110S.gb/1768431‑1768475              |                                tATTCGCATGCCAACTATTGGGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2449107/1‑45 (MQ=38) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCg    >  1:282332/1‑43 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGc   >  1:185701/1‑44 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2875425/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2338934/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2509540/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2544898/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2544927/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2550818/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2555630/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2684873/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:269199/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2705443/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2739828/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2840813/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2121140/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:347085/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:398597/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:420344/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:481717/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:53361/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:551507/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:577828/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:627929/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:705245/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:750997/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:769960/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:875838/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:976225/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1512213/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1016097/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1046530/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:115356/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1288348/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1317482/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1324560/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1349137/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1364372/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1372694/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1374798/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1436267/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1469687/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1493051/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2327242/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1513006/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:158578/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1626067/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1691443/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1724976/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1889816/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1915841/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1938248/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:201867/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2099205/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:1014253/1‑45 (MQ=255) tATTCGCATGCCAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCAGCa  >  1:1553193/1‑45 (MQ=38) tATTCGCATG‑CAACTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCa  >  1:2048575/1‑44 (MQ=37)              |                                TATTCGCATGCCAGCTATTGCGCGTGCGGGCAATTAACGTCCGCA  >  W3110S.gb/1768431‑1768475

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑