Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,046,668	T→G	intergenic (+83/‑18)	yeeI → / → asnT	conserved hypothetical protein/tRNA‑Asn

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,046,668	0	T	G	100.0%	95.3 / NA	29	intergenic (+83/‑18)	yeeI/asnT	conserved hypothetical protein/tRNA‑Asn
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (29/0);  total (29/0)

AATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCA  >  W3110S.gb/2046618‑2046679                                                   |            aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGcc         >  1:783010/1‑55 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2510251/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:952966/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:928152/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:858017/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:849857/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:827362/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:813088/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:732453/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:483669/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:452326/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2865485/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2652186/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2632010/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1012158/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2472118/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2462437/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2311976/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2246357/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:2092568/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1607170/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1561086/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1532777/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1374008/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1335388/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1330046/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1136366/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTct  >  1:1077417/1‑61 (MQ=255) aaTGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATGCGCCCCGTTc   >  1:710439/1‑61 (MQ=255)                                                   |            AATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCA  >  W3110S.gb/2046618‑2046679

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑