| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 2,372,478 | A→C | G246G (GGA→GGC) | yfbF → | undecaprenyl phosphate‑L‑Ara4FN transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 2,372,478 | 0 | A | C | 88.2% | 312.7 / 21.0 | 102 | G246G (GGA→GGC) | yfbF | undecaprenyl phosphate‑L‑Ara4FN transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/12); new base C (0/90); total (0/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTG > W3110S.gb/2372436‑2372505 | gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGTCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:590248/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2478975/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:37343/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:35447/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2912450/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2892463/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2870482/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2823987/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2758512/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2609322/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2517785/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2486785/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:373837/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2457156/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2399924/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2292539/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2281913/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2280775/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2276237/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2249770/62‑1 (MQ=255)gcTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2093819/62‑1 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cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:1341340/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:1006054/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2009800/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:163871/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:1992884/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2111906/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:1846008/61‑1 (MQ=255) cTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2375628/61‑1 (MQ=255) tACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTTCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:493713/60‑1 (MQ=255) aCGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:6832/59‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1320623/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1313213/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1302295/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1301566/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:259370/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:2365783/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1837724/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1645387/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1354199/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:513623/62‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:1480155/62‑1 (MQ=255) gCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTg < 1:963454/61‑1 (MQ=255) cagcaTTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2206602/38‑1 (MQ=255) gcaTTATTGCGATTGGCGGTTTTAGCATTGCGGtgc < 1:2436868/36‑1 (MQ=255) | GCTACGTATGCTGAGTCTGCTCGGCAGCATTATTGCGATTGGAGGTTTTAGCATTGCGGTGCTGCTGGTG > W3110S.gb/2372436‑2372505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |