Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,383,383	G→T	L183I (CTT→ATT)	menD ←	bifunctional 2‑oxoglutarate decarboxylase and SHCHC synthase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,383,383	0	G	T	100.0%	94.4 / NA	29	L183I (CTT→ATT)	menD	bifunctional 2‑oxoglutarate decarboxylase and SHCHC synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (29/0);  total (29/0)

TCGTCCTGCCACCAGTCACCCAGACGCTGTTGCCAGCTAAGCCCGGTATCGTCCATTTCGC  >  W3110S.gb/2383343‑2383403                                         |                     tcgtcCTGCCCCCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTc             >  1:1497267/1‑50 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGt           >  1:1435039/1‑52 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2571730/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:90089/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:419316/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:35053/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:345120/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:303044/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:300350/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:294838/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2850147/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2727559/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2685855/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2684575/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2665500/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2658310/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2657939/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1062728/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2195926/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2177966/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:2165413/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1912598/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1833198/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1753742/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1485187/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1477579/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1190290/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1169846/1‑61 (MQ=255) tcgtcCTGCCACCAGTCGCCCAGCCGCTGTTGCCAGCTAATCCCGGTGTCGTCCATTTCGc  >  1:1156097/1‑61 (MQ=255)                                         |                     TCGTCCTGCCACCAGTCACCCAGACGCTGTTGCCAGCTAAGCCCGGTATCGTCCATTTCGC  >  W3110S.gb/2383343‑2383403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑