Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	2,903,496	T→C	Q193Q (CAA→CAG)	ygcF ←	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	W3110S.gb	2,903,496	0	T	C	100.0%	332.4 / NA	96	Q193Q (CAA→CAG)	ygcF	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/96);  total (0/96)

CGCAATGCAGGTTTCAATGCACAAACGTGTGGCATCATCCTTTTGGCTAATCGGCTGCAGT  >  W3110S.gb/2903454‑2903514                                           |                   cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGTAGt  <  1:1937807/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2587065/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2887726/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2818824/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2814901/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2782650/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2762967/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2737616/61‑1 (MQ=255) cgcAATGCAGGTATCGATACATAAACGCGTAGCATCTTCCTTCTGGCTAATTGGCTGAAGt  <  1:2704780/61‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑