Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,903,511 C→A L188L (CTG→CTT)  ygcF ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,903,5110CA99.0% 324.8 / NA 96L188L (CTG→CTT) ygcFconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base A (0/95);  minor base T (0/1);  total (0/96)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

CGCAATGCAGGTTTCAATGCACAAACGTGTGGCATCATCCTTTTGGCTAATCGGCTGCAGT  >  W3110S.gb/2903454‑2903514
                                                         |   
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                                                         |   
CGCAATGCAGGTTTCAATGCACAAACGTGTGGCATCATCCTTTTGGCTAATCGGCTGCAGT  >  W3110S.gb/2903454‑2903514

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑