Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,029,573	A→G	I5I (ATT→ATC)	ygfT ←	fused predicted oxidoreductase Fe‑S subunit and nucleotide‑binding subunit

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,029,573	0	A	G	100.0%	109.7 / NA	33	I5I (ATT→ATC)	ygfT	fused predicted oxidoreductase Fe‑S subunit and nucleotide‑binding subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (33/0);  total (33/0)

CCGCAGCTTCAGCAGCAATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGTCT  >  W3110S.gb/3029557‑3029618                 |                                              ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2146891/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:982499/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:912987/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:831877/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:817147/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:62995/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:555129/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:293622/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2721758/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:264334/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2548579/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2478194/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2265478/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:224779/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1014307/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1617281/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1106015/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1109147/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1223447/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:126568/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1428861/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:152901/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2145610/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1716890/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:1758063/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2004898/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2058437/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2120751/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2134983/1‑62 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtc   >  1:1659951/1‑61 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtc   >  1:741546/1‑61 (MQ=255) ccGCAGCTTCAGCAGCGATAAACTTAATCATTTGCATCCCTTTCAtt                 >  1:633231/1‑47 (MQ=39) ccGCAGCGTCAGCAGCGATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGtct  >  1:2721659/1‑62 (MQ=255)                 |                                              CCGCAGCTTCAGCAGCAATAAACTTATTCATTTGCATCCCTTTCATTTAATGAGTTATGTCT  >  W3110S.gb/3029557‑3029618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑