Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,193,007	T→G	G496G (GGT→GGG)	yqiK →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,193,007	0	T	G	100.0%	160.7 / NA	48	G496G (GGT→GGG)	yqiK	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (0/48);  total (0/48)

CAGGTCGATGGTCTGAATCGTGGCGGCGCTGCGGGTGATGCAAACACGGGTAATGTGGGGGGC  >  W3110S.gb/3192957‑3193019                                                   |             cAGGTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTgggggc   <  1:1969405/62‑2 (MQ=255)   gggcGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2021171/58‑1 (MQ=255)   ggTGGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2307232/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2410766/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1001198/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2199518/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2221971/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2229821/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2302457/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:237299/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2375896/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2080745/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2487621/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2699843/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2889059/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:373670/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:512423/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:531079/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:679932/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:687253/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:748688/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1434721/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1006917/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1047558/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1097584/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1103906/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1182095/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1239652/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1346343/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1416300/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1916515/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1520762/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1536451/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1556065/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1575608/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1811641/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1866035/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1878631/61‑1 (MQ=255)   ggTCGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGGGGGGGGc  <  1:27939/61‑1 (MQ=255)      cGATGGGCTGAATCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1141657/58‑1 (MQ=255)         tGGGCTGAATCTTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2651013/55‑1 (MQ=255)                 aTCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2340040/47‑1 (MQ=255)                 aTCGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1570933/47‑1 (MQ=255)                  tCGTGGTGGCGCTACGGGGGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:677614/46‑1 (MQ=255)                   cGTGGTGGCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2355642/45‑1 (MQ=255)                     tggtggCGCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1776202/43‑1 (MQ=37)                       gtggcgCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:1747732/39‑1 (MQ=38)                       ggggcgCTACGGGTGATGCAAACACGGGGAATGTGGGGGGc  <  1:2843487/39‑1 (MQ=38)                                                   |             CAGGTCGATGGTCTGAATCGTGGCGGCGCTGCGGGTGATGCAAACACGGGTAATGTGGGGGGC  >  W3110S.gb/3192957‑3193019

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑