| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 137,443 | C→T | P121S (CCA→TCA) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 137,443 | 0 | C | T | 89.8% | 128.5 / 4.2 | 49 | P121S (CCA→TCA) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/0); new base T (44/0); total (49/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTG > W3110S.gb/137421‑137495 | cggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTc > 1:2704163/1‑39 (MQ=255)cggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGATCGTTGATCAAc > 1:2901252/1‑62 (MQ=255)cggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAGCGTTGATCAAc > 1:1362871/1‑62 (MQ=255)cggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCaa > 1:2584985/1‑61 (MQ=255)cggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAAc > 1:1548265/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATGAACCTGCCGCTACctg > 1:1869611/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTa > 1:2206900/1‑58 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:32718/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2334604/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2350459/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2358561/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2641422/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2689911/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2774923/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:279555/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:313650/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2262542/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:342881/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:420137/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:494758/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:508762/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:587195/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:680192/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:690320/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:696188/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:90766/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1918496/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1175434/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1186720/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1254398/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1306937/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1383366/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1639807/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1640916/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:177534/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2281602/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1935576/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1985765/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2011245/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2012409/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2055518/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2066300/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2072659/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:2245033/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:1020131/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCGACctg > 1:2652406/1‑62 (MQ=255) attattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTAGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:854101/1‑62 (MQ=255) attattCAGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGAGACGTAGAACGTTGATCAACCAGCCGCTACct > 1:1626035/1‑61 (MQ=255) agtattCCGTCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACctg > 1:189445/3‑62 (MQ=255) | CGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTG > W3110S.gb/137421‑137495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |