Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	142,083	G→A	T196T (ACC→ACT)	can ←	carbonic anhydrase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	142,083	0	G	A	100.0%	188.6 / NA	56	T196T (ACC→ACT)	can	carbonic anhydrase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/56);  total (0/56)

TTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAA  >  W3110S.gb/142062‑142123                      |                                         ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2794655/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:208138/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2097443/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2155952/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2216221/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2336640/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2361379/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:238201/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2407198/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2474936/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2579829/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2645631/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2760009/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1198717/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2838069/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:319622/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:388036/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:544949/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:596894/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:611459/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:650955/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:675382/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:775615/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:800518/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:840728/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:929045/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1646929/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1101215/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1223444/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1275181/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1392719/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1416770/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1443037/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1475158/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1521545/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1522837/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:156718/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1594055/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1607314/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2080698/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1687592/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1700733/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1718683/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1744250/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1844415/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1856433/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1887481/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1968199/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2046801/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2070382/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2073032/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGAGaa  <  1:2090778/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTAGTGaa  <  1:389534/62‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGGGTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:2209554/62‑1 (MQ=255)  tGCTCAAGGGTTTCGCGGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:24202/61‑1 (MQ=255)                 cgGTTAGTCGCTGTGACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGaa  <  1:1613816/46‑1 (MQ=255)                      |                                         TTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAA  >  W3110S.gb/142062‑142123

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑