Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,675,333	A→G	Y224Y (TAT→TAC)	rep ←	DNA helicase and single‑stranded DNA‑dependent ATPase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,675,333	0	A	G	100.0%	43.9 / NA	20	Y224Y (TAT→TAC)	rep	DNA helicase and single‑stranded DNA‑dependent ATPase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (20/0);  total (20/0)

CCAGCAGTTTCACCAGCTCATACTGGCTGGTGTTGGTGTCCT  >  W3110S.gb/3675314‑3675355                    |                       ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2275134/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:900961/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:77495/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:745508/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:73529/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2921049/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2898602/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2791/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2438582/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2349785/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1227808/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2151663/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:2097116/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1999855/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1754213/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1730205/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1720946/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1630491/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1480185/1‑42 (MQ=19) ccaGCAGCTTGACCAGCTCGTACTGGCAGGTATTGGTGTCCt  >  1:1264389/1‑42 (MQ=19)                    |                       CCAGCAGTTTCACCAGCTCATACTGGCTGGTGTTGGTGTCCT  >  W3110S.gb/3675314‑3675355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑