Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,687,566	C→T	P295S (CCA→TCA)	yifB →	predicted bifunctional protein, enzyme and transcriptional regulator

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,687,566	0	C	T	100.0%	77.4 / NA	24	P295S (CCA→TCA)	yifB	predicted bifunctional protein, enzyme and transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (24/0);  total (24/0)

GCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTCCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGT  >  W3110S.gb/3687542‑3687603                         |                                      gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCg   >  1:650774/1‑61 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCg   >  1:1414271/1‑61 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2393870/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:982741/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:976445/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:951095/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:612258/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:455100/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:283843/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2766755/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2735262/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2683985/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2398196/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1019921/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2088091/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:2068237/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1776764/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1734966/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1547651/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1256161/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1188798/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1188380/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:107032/1‑62 (MQ=255) gCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTTCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGt  >  1:1057897/1‑62 (MQ=255)                         |                                      GCGATGGTAGGCGGTGGCGCAATTCCAGGGCCCGGTGAAATTTCGCTGGCGCATAACGGCGT  >  W3110S.gb/3687542‑3687603

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑