Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,736,091	G→A	E5K (GAA→AAA)	yieL →	predicted xylanase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,736,091	0	G	A	100.0%	113.8 / NA	35	E5K (GAA→AAA)	yieL	predicted xylanase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/35);  total (0/35)

TCTGGTGGTAATGGAACTTAATGAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTAA  >  W3110S.gb/3736069‑3736130                       |                                        tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:365181/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1064828/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2391994/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2516691/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2547489/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2558530/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2560917/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2765003/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2827786/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2356313/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:514801/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:562521/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:718074/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:791823/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:827456/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:852101/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:856268/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1668037/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1125080/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1131690/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1233745/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1423186/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1460297/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1493237/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:159858/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:2245997/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1797171/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1814483/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1878389/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:188226/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1912974/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1952364/62‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:1953125/62‑1 (MQ=255)  cTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:643415/61‑1 (MQ=255)  cTGGTGGTAATGGAACTTAATAAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTaa  <  1:240803/61‑1 (MQ=255)                       |                                        TCTGGTGGTAATGGAACTTAATGAAAGGAATATTACGATGAATATAAAAATTGCTGCTTTAA  >  W3110S.gb/3736069‑3736130

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑