Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,763,473	T→C	I3I (ATT→ATC)	yidA →	predicted hydrolase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,763,473	0	T	C	100.0%	346.3 / NA	100	I3I (ATT→ATC)	yidA	predicted hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/100);  total (0/100)

CCAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATTAAACTC  >  W3110S.gb/3763445‑3763479                             |       ccAATCTTCCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:959587/35‑1 (MQ=37) ccAATCTGCCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2330643/35‑1 (MQ=37) ccAATCTACCTGGGGGACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2773746/35‑1 (MQ=37) ccAATCTACCTGGGGATCTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1588041/35‑1 (MQ=37) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2685139/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2873216/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2839143/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2837551/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2835518/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2777826/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2768082/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2761140/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:275615/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2728792/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2706263/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2686533/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2875982/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2677449/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2637798/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2634554/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2616103/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2609057/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2606335/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2545618/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2508170/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2455267/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2439625/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:521773/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:974482/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:911993/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:886595/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:87752/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:809726/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:748067/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:722909/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:674113/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:639339/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:63438/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:604373/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2873949/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:515189/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:49516/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:475123/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:433797/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:41037/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:368842/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:34619/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:310645/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2914091/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2902614/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2401973/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1228392/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1724326/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1697711/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1683206/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1681454/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1605815/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:160381/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1584758/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1474725/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1403630/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1352149/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1351858/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1315829/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:181675/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1196441/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1147093/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1146690/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1128732/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1085505/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1084976/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1039442/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:103688/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:102882/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1023376/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1020435/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2110419/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1017602/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2396728/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2395547/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2393544/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2321381/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2301828/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:22221/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2219691/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:218508/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2177601/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:2164206/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:242097/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:208880/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1971410/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1961645/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1954600/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1940950/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1928394/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1921259/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1899335/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1873682/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1864140/35‑1 (MQ=255) ccAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATCAAACTc  <  1:1859077/35‑1 (MQ=255)                             |       CCAATCTACCTGGGGAACTCATGGCTATTAAACTC  >  W3110S.gb/3763445‑3763479

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑