Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	163,868	A→G	L588L (CTA→CTG)	hrpB →	predicted ATP‑dependent helicase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	163,868	0	A	G	100.0%	213.8 / NA	63	L588L (CTA→CTG)	hrpB	predicted ATP‑dependent helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (63/0);  total (63/0)

TGTGGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACAAATCGGTCAG  >  W3110S.gb/163820‑163880                                                 |             tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGGTGCAAATTGGTCAg  >  1:1558733/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAGATTGGTCAg  >  1:2511071/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCa   >  1:1301226/1‑60 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:343712/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2133938/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2178102/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2279652/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2364445/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:238706/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:246629/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2515528/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2599963/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2609809/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:272111/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2760036/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2778972/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2849931/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2111765/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:431125/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:474037/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:480881/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:493706/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:523535/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:588703/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:597822/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:747946/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:80945/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:839986/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:849809/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:961002/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:977813/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2060983/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:107004/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1076310/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1087913/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1106568/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1136673/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1142629/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:121207/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1231722/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1278135/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1334342/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1337747/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1397520/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1417031/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1443850/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1047649/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1562134/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1614770/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1671005/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1704005/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:173526/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2056158/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1535396/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1750568/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1797324/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:188791/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1919316/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1935560/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:1948250/1‑61 (MQ=255) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCAGCaaa          >  1:571761/1‑53 (MQ=38) tgtgGCGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGACTGCAAATTGGTCAg  >  1:2881945/1‑61 (MQ=255) tgtgGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTGCAAATTGGTCAg  >  1:2595110/1‑61 (MQ=255)                                                 |             TGTGGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACAAATCGGTCAG  >  W3110S.gb/163820‑163880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑