Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,928,880	G→C	Q157H (CAG→CAC)	yhjX →	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,928,880	0	G	C	94.1%	107.3 / ‑0.8	34	Q157H (CAG→CAC)	yhjX	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/2);  new base C (32/0);  total (32/2)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-03
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01

TCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGAAACGGTCGGTCTGGAAAAAACCTTT  >  W3110S.gb/3928825‑3928913                                                        |                                  tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:961048/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:908205/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:2474707/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:812226/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1200197/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1203147/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:2233400/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1829160/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1802164/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1760871/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:464528/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgct                              >  1:1445825/1‑61 (MQ=255) tCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAgctgc                               >  1:2401721/1‑60 (MQ=255)     tATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCGGCTGCTGGaa                          <  1:143156/61‑1 (MQ=255)     tATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGaa                          <  1:86191/61‑1 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGGACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1797450/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:45740/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:432481/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:573925/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:708455/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2823605/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:730027/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2768693/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:275985/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2640914/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:803155/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2558658/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2118999/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1628118/1‑62 (MQ=255)                            gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1007621/1‑62 (MQ=255) 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                           gCCTGGGTTTTAAATTTATCGAAACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:254607/1‑62 (MQ=255)                                                        |                                  TCGCTATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGAAACGGTCGGTCTGGAAAAAACCTTT  >  W3110S.gb/3928825‑3928913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑