Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,928,886	G→C	L159L (CTG→CTC)	yhjX →	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,928,886	0	G	C	94.1%	107.5 / ‑0.8	34	L159L (CTG→CTC)	yhjX	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/2);  new base C (32/0);  total (32/2)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-03
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01

TATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGAAACGGTCGGTCTGGAAAAAACCTTT  >  W3110S.gb/3928829‑3928913                                                          |                            tATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCGGCTGCTGGaa                          <  1:143156/61‑1 (MQ=255) tATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGaa                          <  1:86191/61‑1 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGGACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1797450/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2360220/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2118999/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2366618/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2558658/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2640914/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:275985/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2768693/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:2823605/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:432481/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:45740/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:573925/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:708455/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:730027/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:803155/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1611118/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1007621/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1066754/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1092044/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1157030/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1258206/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1293669/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:131676/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:137923/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1004336/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1628118/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1750825/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1812186/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1866703/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:1942397/1‑62 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGACACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCt    >  1:252010/1‑60 (MQ=255)                        gCCTGGGTTTTAAATTTATCGAAACGCACCTGCTCGAAACGGTGGGTCTGGAAAAAACCttt  >  1:254607/1‑62 (MQ=255)                                                          |                            TATCGGTTCTTATGGTCTGGGTAGCCTGGGTTTCAAATTTATCGACACGCAGCTGCTGGAAACGGTCGGTCTGGAAAAAACCTTT  >  W3110S.gb/3928829‑3928913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑