Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,013,775	T→A	I54I (ATT→ATA)	yhhJ →	predicted transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,013,775	0	T	A	100.0%	146.9 / NA	44	I54I (ATT→ATA)	yhhJ	predicted transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (0/44);  total (0/44)

GATCGCCATTGCCGATATGGATCAATCGCAGTTATCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATC  >  W3110S.gb/4013766‑4013827          |                                                     gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:338512/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2598315/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2679422/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2694723/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2777293/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2796043/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2889677/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2901885/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:291201/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:305386/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:328483/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2582839/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:364068/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:487975/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:565569/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:70030/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:747758/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:771000/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:798897/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:820534/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:935358/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:997054/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1683225/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1148974/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1216699/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1235136/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1318437/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1324616/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:133941/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1348193/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1524855/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:162574/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1632245/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1053865/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1783457/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1794852/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:1799684/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:204661/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2059240/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2280762/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2446513/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2512364/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2553802/62‑1 (MQ=255) gATCGCCATAGCCGATATGGATCAATCGCAGTTGTCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATc  <  1:2575046/62‑1 (MQ=255)          |                                                     GATCGCCATTGCCGATATGGATCAATCGCAGTTATCGAACCGGATCGTTAACAGCTTCTATC  >  W3110S.gb/4013766‑4013827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑