Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,068,084	G→A	A390A (GCG→GCA)	glgB →	1,4‑alpha‑glucan branching enzyme

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,068,084	0	G	A	100.0%	111.1 / NA	37	A390A (GCG→GCA)	glgB	1,4‑alpha‑glucan branching enzyme
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (37/0);  total (37/0)

GTAACTTCCTCGTCGGTAACGCGCTTTACTGGATTGAACGTTTTG  >  W3110S.gb/4068062‑4068106                       |                       gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGATCGTTTTg  >  1:1167802/1‑45 (MQ=255) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGtttt   >  1:2521328/1‑44 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGtttt   >  1:1532032/1‑44 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGtttt   >  1:397933/1‑44 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2513707/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:837873/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2580758/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2640011/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:266895/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2672180/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2683238/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2721583/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:288669/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:370131/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:404040/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:409231/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:424569/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:457790/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1164016/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2069229/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1423958/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1461064/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1547858/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1582782/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1609829/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1833139/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:1915107/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2454121/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2070288/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2071137/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:211462/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2208075/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2293512/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2348650/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2355114/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTTACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:2365732/1‑45 (MQ=38) gTAACTTCCTTGTCGGTAACGCACTTAACTGGATTGAACGTTTTg  >  1:554193/1‑45 (MQ=37)                       |                       GTAACTTCCTCGTCGGTAACGCGCTTTACTGGATTGAACGTTTTG  >  W3110S.gb/4068062‑4068106

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑