Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	339,424	C→T	N12N (AAC→AAT)	yahI →	predicted carbamate kinase‑like protein

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	339,424	0	C	T	100.0%	152.7 / NA	47	N12N (AAC→AAT)	yahI	predicted carbamate kinase‑like protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/47);  total (0/47)

TAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAACAGCATTAT  >  W3110S.gb/339373‑339432                                                    |         tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:390068/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1185407/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1995691/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2140450/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2345042/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2354526/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2357912/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2420298/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2433851/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2446063/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2514389/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:370638/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1989306/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:434238/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:437902/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:444376/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:578078/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:638512/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:655904/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:762653/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:814954/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:850759/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:909678/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1547337/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1288189/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1329868/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1331086/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1360920/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1401536/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1440784/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1501472/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1511090/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1530426/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1953288/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1566666/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1584979/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1683233/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1736913/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1823337/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:184247/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1844976/60‑1 (MQ=255) tAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1895309/60‑1 (MQ=255)  aGCTGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:503432/59‑1 (MQ=255)  aGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:2706471/59‑1 (MQ=255)  aGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1427892/59‑1 (MQ=255)  aGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1862880/59‑1 (MQ=255)                    aaaGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAATAGCATTAt  <  1:1755141/41‑1 (MQ=255)                                                    |         TAGCGGACATAACAACATGAAAGAGCTTGTGGTCGTTGCCATTGGTGGCAACAGCATTAT  >  W3110S.gb/339373‑339432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑