Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 460,129 C→T T673M (ACG→ATG)  lon → DNA‑binding ATP‑dependent protease La

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb460,1290CT100.0% 188.7 / NA 57T673M (ACG→ATG) lonDNA‑binding ATP‑dependent protease La
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (23/34);  total (23/34)

AAAACGTGACATCCACGTCCACGTACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGG  >  W3110S.gb/460091‑460153
                                      |                        
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                    acgtACCGGAAGGTGCGATGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:1212639/1‑43 (MQ=255)
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                    acgtACCGGAAGGTGCGATGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:521806/1‑43 (MQ=255)
                    acgtACCGGAAGGTGCGATGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:458337/1‑43 (MQ=255)
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                    acgtACCGGAAGGTGCGATGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:443006/1‑43 (MQ=255)
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                    acgtACCGGAAGGTGCGATGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:1411198/1‑43 (MQ=255)
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                    acgtACCGGAAGGTGCGATGACGAAAGATGGTCCGAGTGCCgg  >  1:2551042/1‑43 (MQ=38)
                                      |                        
AAAACGTGACATCCACGTCCACGTACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGG  >  W3110S.gb/460091‑460153

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: