Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 502,555 C→T intergenic (‑93/+145) ybaL ← / ← fsr predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain/predicted fosmidomycin efflux system

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb502,5550CT100.0% 118.3 / NA 38intergenic (‑93/+145)ybaL/fsrpredicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain/predicted fosmidomycin efflux system
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/38);  total (0/38)

CAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTG  >  W3110S.gb/502536‑502576
                   |                     
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2754669/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1003812/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2406466/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2407421/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2432408/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2586332/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2624058/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2708330/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2711293/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2752189/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2296339/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2848540/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2895755/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:319395/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:347345/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:470577/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:474278/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:725367/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:948260/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1771247/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1055758/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1066962/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1212997/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1300028/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1553059/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1596592/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1662518/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1750565/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1803831/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1842352/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1869948/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1883011/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1886456/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1902046/41‑1 (MQ=37)
cAATTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2095261/41‑1 (MQ=37)
 aaTTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2112275/40‑1 (MQ=37)
 aaTTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:1489508/40‑1 (MQ=37)
 aaTTTCATTGATGATGTTTATGAATAATTGTTGAATTTTg  <  1:2586217/40‑1 (MQ=37)
                   |                     
CAATTTCATTGATGATGTTCATGAATAATTATTGAATTTTG  >  W3110S.gb/502536‑502576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: