Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	961,387	C→T	D234D (GAC→GAT)	ycaL →	predicted peptidase with chaperone function

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	961,387	0	C	T	100.0%	124.3 / NA	38	D234D (GAC→GAT)	ycaL	predicted peptidase with chaperone function
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (38/0);  total (38/0)

CTGGCTAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGACTCTCAC  >  W3110S.gb/961346‑961393                                          |       cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGAttct     >  1:1389719/1‑45 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:327852/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2488371/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2569761/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:266017/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2689111/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2796908/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2835861/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:288963/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:306718/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:324798/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:246898/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:45868/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:520988/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:692543/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:855416/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:905221/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:922000/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:924401/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:959087/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1500036/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1072981/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1073212/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1076463/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1105041/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1175996/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:131464/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1326422/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1396811/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1014041/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1591726/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1654434/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1723787/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1745074/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:1765202/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2033743/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2153228/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:2214446/1‑48 (MQ=38) cTGGCCAGCCTGGATGGCGGTCGCACACAGTCCATGTTTGATTCTcac  >  1:757828/1‑48 (MQ=37)                                          |       CTGGCTAGCCTGGATGGCGGTCGCACCCAGTCCATGTTTGACTCTCAC  >  W3110S.gb/961346‑961393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑