Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,019,074	C→T	G56G (GGC→GGT)	ycbG →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,019,074	0	C	T	97.1%	106.0 / ‑4.2	34	G56G (GGC→GGT)	ycbG	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (1/0);  new base T (33/0);  total (34/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01

CCGTCGATGTGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGCTGGATTGACAAGCATATGAATCCGGAACTG  >  W3110S.gb/1019025‑1019104                                                  |                               ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTTACaa                     >  1:1200045/1‑61 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGATAAg                    >  1:1068331/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACaa                     >  1:920230/1‑61 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACaa                     >  1:2494878/1‑61 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACaa                     >  1:2743829/1‑61 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2253263/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:943842/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2261556/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2296790/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2354883/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2361647/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2875797/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2921916/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:364779/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:483441/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:700123/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:71420/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:828235/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2204159/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2194566/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2068604/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:2012801/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1933989/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1806563/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1784879/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1766906/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:175880/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:172058/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1616968/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1398009/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1393537/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1343440/1‑62 (MQ=255) ccGTCGATGAGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGTTGGATTGACAAg                    >  1:1338193/1‑62 (MQ=255)                   cGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGCTGGATTGACAAGCATATGAATCCGGAACTg  >  1:190657/1‑62 (MQ=255)                                                  |                               CCGTCGATGTGTTGCTCTCGCTGGAAAATGAACCCGTGCTGGTAAATGGCTGGATTGACAAGCATATGAATCCGGAACTG  >  W3110S.gb/1019025‑1019104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑