| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 2,528,189 | 2 bp→AA | coding (1242‑1243/1257 nt) | xapB ← | xanthosine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 2,528,189 | 0 | C | A | 81.7% | 192.3 / 53.7 | 104 | A415S (GCG→TCA) | xapB | xanthosine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/0); new base A (85/0); total (104/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
| * | W3110S.gb | 2,528,190 | 0 | T | A | 81.7% | 249.7 / 39.0 | 104 | R414R (CGA→CGT) | xapB | xanthosine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (19/0); new base A (85/0); total (104/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GAGCCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTAA > W3110S.gb/2528160‑2528227 || gagcCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATtat > 1:2450781/1‑62 (MQ=255)gagcCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATtat > 1:2554818/1‑62 (MQ=255)gagcCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATtat > 1:2802025/1‑62 (MQ=255)gagcCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATtat > 1:1948764/1‑62 (MQ=255)gagcCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTAGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATtat > 1:1449487/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGCTGCTTTATCTTTTAAGGGTCATGATTATAttt > 1:1963887/1‑61 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:956817/1‑52 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATAtttt > 1:2244351/1‑61 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATAttt > 1:737341/1‑61 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATAttt > 1:1203596/1‑61 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATAttt > 1:432482/1‑61 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTa > 1:573333/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTa > 1:2026406/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTa > 1:56219/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTa > 1:2789608/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTa > 1:21775/1‑62 (MQ=255) gcgAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGA‑TATATTTaa > 1:144452/1‑62 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCa > 1:1353614/1‑48 (MQ=19) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCa > 1:2731249/1‑48 (MQ=19) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCAt > 1:2047810/1‑49 (MQ=19) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2596673/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:252843/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2538083/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2547524/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2386962/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2764035/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2760717/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:925705/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2758263/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2614988/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2706623/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:873039/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2668767/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2660494/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2642001/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2496826/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2641869/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:365364/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:719608/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:632752/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:618760/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:562363/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:514869/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:48592/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:47934/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:479136/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:477219/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2834725/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:361228/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:360765/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:359643/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:336976/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2926487/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:880497/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:911358/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:290611/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1546935/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1859617/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1817116/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1793606/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1782614/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1770846/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1690151/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1688744/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1630360/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1625816/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1548974/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1892590/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1495041/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1401541/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1388821/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1388083/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1381079/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:136399/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1283916/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1224636/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1181710/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1124995/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2243902/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:243501/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2416975/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2407870/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1035236/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2330263/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2309392/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2309276/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2293207/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2284408/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2250274/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2444135/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2219034/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:221199/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2157406/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2057602/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:2018210/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1997431/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1987163/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1982124/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1943730/1‑50 (MQ=255) gAATCCTTTTAATGTGTAACTGAACGATGCGTTATCTTTTCAGGGTCATg > 1:1914361/1‑50 (MQ=255) || GAGCCGCGAATCCTTTTAATGAGTCACCGCTCGATGCTTTATCTTTTCAGGGTCATGATTATATTTAA > W3110S.gb/2528160‑2528227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |