Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,167,349	Δ1 bp	coding (24/333 nt)	yegP →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,167,349	0	T	.	100.0%	320.8 / NA	75	coding (24/333 nt)	yegP	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base . (75/0);  total (75/0)

CTGGTTGGTTTGAACTCAGTAAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGC  >  W3110S.gb/2167330‑2167391                    |                                           cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCGGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:1177886/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCgg                    >  1:1254376/1‑43 (MQ=39) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCt            >  1:1214274/1‑51 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTaaa         >  1:1099142/1‑54 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCgg    >  1:698224/1‑59 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:513698/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:655901/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:65504/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:629599/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:624351/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:597810/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:585373/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:565081/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:703932/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:486460/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:45942/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:419945/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:418552/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:417988/1‑61 (MQ=255) cTGGTTGGTTTGAACTCAG‑AAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGc  >  1:390382/1‑61 (MQ=255) 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                   |                                           CTGGTTGGTTTGAACTCAGTAAGAGCAGTGATAATCAGTTCCGGTTTGTGCTAAAAGCGGGC  >  W3110S.gb/2167330‑2167391

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑