Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,084,437 Δ1 bp coding (131/1977 nt) speA ← biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,084,4340C.100.0% 439.4 / NA 101coding (134/1977 nt)speAbiosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base . (19/82);  total (19/82)

Only 100 of 101 total aligned reads displayed.

TAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTGCCCCACCAGGCAATATTGTAAGTACGCAGCATCTTG  >  W3110S.gb/3084396‑3084469
                                      |                                   
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tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:450378/62‑1 (MQ=255)
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tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:419270/62‑1 (MQ=255)
tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:401282/62‑1 (MQ=255)
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tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:396668/62‑1 (MQ=255)
tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:347923/62‑1 (MQ=255)
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tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:304879/62‑1 (MQ=255)
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tAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTG‑CCCACCAGGCAATATTGTAAGTAc             <  1:253171/62‑1 (MQ=255)
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                                      |                                   
TAATGTGGCCCAGCTCGTTAACGTCATAGTAGTTATTGCCCCACCAGGCAATATTGTAAGTACGCAGCATCTTG  >  W3110S.gb/3084396‑3084469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑