Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	435,369	+T	coding (512/978 nt)	thiL →	thiamin‑monophosphate kinase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	435,365	1	.	T	100.0%	222.4 / NA	78	I170F (ATT→TTT)	thiL	thiamin‑monophosphate kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base T (78/0);  total (78/0)

CCGGGCTGGCGA‑TTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTAAA  >  W3110S.gb/435354‑435400             |                                    ccgGGCTGGCGATTTTTGCGAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:1645792/1‑48 (MQ=38) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGtt              >  1:1489723/1‑36 (MQ=37) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTg             >  1:376745/1‑37 (MQ=38) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGc            >  1:447007/1‑38 (MQ=38) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:292624/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:50612/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:498970/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:411648/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:394692/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:332955/1‑48 (MQ=255) ccgGGCTGGCGATTTTTGCAAAACCGTTTGCAGGTTGCCGATGCTaaa  >  1:293234/1‑48 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑