Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3252708	3252834	127	45 [0]	[0] 114	yhaJ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

GCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGT  >  W3110S.gb/3252646‑3252707                                                              | gcgcCCTCTCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1409790/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:507139/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:31944/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:322361/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:368417/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:373165/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:375081/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:390448/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:406197/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:408950/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:426655/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:496086/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:293915/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:510794/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:561631/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:672321/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:72801/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:757641/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:786803/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:94100/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:942834/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:984513/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1429421/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:106192/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:113351/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1150229/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1159759/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1241422/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1247954/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1263533/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1286476/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1305670/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1470943/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1496221/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1554537/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1597131/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:1608134/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:231749/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:262721/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:280246/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:283811/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGACCCGAGCGGt  <  1:1005872/62‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGACCCGAGCGGt  <  1:705993/62‑1 (MQ=255)  cgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:163160/61‑1 (MQ=255)  cgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGt  <  1:822893/61‑1 (MQ=255)                                                              | GCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGT  >  W3110S.gb/3252646‑3252707

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑