Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3253213	3253278	66	72 [0]	[0] 19	yhaK	predicted pirin‑related protein

ATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAG  >  W3110S.gb/3253150‑3253212                                                               | aTCCCAAAGTCGATA‑TTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:152154/62‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:522956/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:61801/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:603484/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:59081/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:580224/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:565331/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:543916/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:533440/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:618823/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:51182/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:509414/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:478748/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:352438/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:317656/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:280598/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:271578/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1012559/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:84041/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:996548/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:982365/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:967281/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:957456/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:950462/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:93719/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:923631/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:916767/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:238878/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:820106/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:756793/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:748552/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:742620/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:734687/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:716664/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:643231/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1145267/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1305804/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1304822/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1292324/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1278098/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1212906/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1194589/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1191676/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1189671/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1314536/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1125754/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1124946/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1102625/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:108189/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:10623/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1056996/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1052110/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1021425/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:156377/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:199448/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1760/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1613726/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1581468/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:157672/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1566445/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:156573/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:233674/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1525839/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1524044/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1499778/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1368371/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1330621/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATAGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1532468/60‑1 (MQ=255)    ccAAAGTCGATATTTTAAATGCGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:1279872/60‑1 (MQ=255)     cAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:527632/59‑1 (MQ=255)     cAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:431962/59‑1 (MQ=255)               atTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAg  <  1:255747/49‑1 (MQ=255)                                                               | ATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAG  >  W3110S.gb/3253150‑3253212

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑