Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3271049	3271576	528	31 [0]	[0] 61	garK	glycerate kinase I

TCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAT  >  W3110S.gb/3270987‑3271048                                                              | tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1650580/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:931044/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:903797/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:890242/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:88681/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:86036/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:826017/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:650227/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:557997/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:44879/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:431808/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:366306/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:342654/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:247206/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1071678/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1582672/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1554875/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1542878/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1386981/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1378954/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1361755/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1341211/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1325309/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1258438/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1226124/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1178387/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1145271/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1087844/62‑1 (MQ=255) tCCCTTTTGTGGGCCAAAGAAGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:499831/62‑1 (MQ=255)  cccTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:422224/61‑1 (MQ=255)  cccTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAt  <  1:1189646/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCCCTTTTGTGGGCCAAAGATGCGCGATGCGCCGTTATCGCCCACCAGCGGATTGGTGACAT  >  W3110S.gb/3270987‑3271048

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑