Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3289638	3289676	39	53 [0]	[0] 16	yraJ	predicted outer membrane protein

GACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGAA  >  W3110S.gb/3289577‑3289637                                                             | gACTCTCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:854563/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:854639/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:517658/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:542844/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:553377/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:564121/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:632105/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:66785/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:678400/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:678688/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:68587/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:702561/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:800010/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:517499/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:857058/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:858229/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:884787/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:896628/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:905881/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:926628/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:94176/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:941815/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:944602/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:946635/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:95530/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:969768/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:474717/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1130208/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1137289/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1208357/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1230589/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1243361/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1289581/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1378756/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1449342/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1463772/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1466324/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1499322/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1579739/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1580918/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1602294/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1641447/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:169865/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:296201/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:349039/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:420599/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:428812/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1003699/61‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGCGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1316723/61‑1 (MQ=255)  aCTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1491318/60‑1 (MQ=255)  aCTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1594256/60‑1 (MQ=255)   cTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:712196/59‑1 (MQ=255)     aTCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGaa  <  1:1123898/57‑1 (MQ=255)                                                             | GACTATCAGGCAAAATGGTTATGTGATCTATCAAAGCAACGTGTCAGCGGGTGCCTTTGAA  >  W3110S.gb/3289577‑3289637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑